Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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