Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Med27Q9DB40 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms