Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TrmuQ9DAT5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrmuQ9DAT5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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