Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Subh2bvQ9D9Z7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms