Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q9D7E4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q9D7E4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms