Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms