Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tube1Q9D6T1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tube1Q9D6T1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms