Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc94Q9D6J3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms