Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930449I24RikQ9D5E3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms