Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PrameQ9D4Z5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrameQ9D4Z5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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