Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Phf6Q9D4J7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Phf6Q9D4J7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf6Q9D4J7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms