Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lonrf3Q9D4H7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms