Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfap53Q9D439 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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