Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Pramef12Q9D2F1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramef12Q9D2F1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pramef12Q9D2F1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pramef12Q9D2F1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pramef12Q9D2F1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramef12Q9D2F1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms