Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Trappc6bQ9D289 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc6bQ9D289 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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