Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms