Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syf2Q9D198 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms