Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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