Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms