Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG9

Pdzd11, PDZ domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd11Q9CZG9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pdzd11Q9CZG9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pdzd11Q9CZG9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pdzd11Q9CZG9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pdzd11Q9CZG9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pdzd11Q9CZG9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pdzd11Q9CZG9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pdzd11Q9CZG9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd11Q9CZG9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pdzd11Q9CZG9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pdzd11Q9CZG9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms