Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms