Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc3Q9CW03 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smc3Q9CW03 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc3Q9CW03 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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