Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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