Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms