Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms