Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CQ90 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q9CQ90 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms