Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl27Q99N92 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms