Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brms1Q99N20 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms