Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms