Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms