Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms