Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ciao1Q99KN2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ciao1Q99KN2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms