Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rab28Q99KL7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rab28Q99KL7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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