Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hps4Q99KG7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms