Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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