Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Smim11aQ99J19 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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