Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usb1Q91W78 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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