Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms