Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Stx18Q8VDS8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Stx18Q8VDS8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms