Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Fam20bQ8VCS3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Fam20bQ8VCS3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Fam20bQ8VCS3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam20bQ8VCS3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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