Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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