Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Dnajc28Q8VCE1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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