Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms