Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms