Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms