Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl47Q8K2Y7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl47Q8K2Y7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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