Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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