Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrit1Q8K099 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms