Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms