Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Upp2Q8CGR7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms